Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.09□□□□□ -0.95
Tnp1P10856 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.08□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.06□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.05□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.04□□□□□ -0.96
Tnp1P10856 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC9.04□□□□□ -0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms