Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHGAP10645 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHGAP10645 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHGAP10645 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.52■■■■□ 3.28
CHGAP10645 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHGAP10645 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
CHGAP10645 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHGAP10645 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHGAP10645 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHGAP10645 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
CHGAP10645 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHGAP10645 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHGAP10645 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHGAP10645 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
CHGAP10645 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
CHGAP10645 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHGAP10645 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
CHGAP10645 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
CHGAP10645 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
CHGAP10645 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHGAP10645 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CHGAP10645 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
CHGAP10645 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
CHGAP10645 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHGAP10645 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHGAP10645 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
CHGAP10645 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHGAP10645 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHGAP10645 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHGAP10645 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHGAP10645 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
CHGAP10645 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHGAP10645 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
CHGAP10645 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHGAP10645 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
CHGAP10645 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
CHGAP10645 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHGAP10645 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHGAP10645 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
CHGAP10645 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHGAP10645 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHGAP10645 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.4■■■■□ 3.26
CHGAP10645 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
CHGAP10645 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHGAP10645 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHGAP10645 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHGAP10645 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
CHGAP10645 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHGAP10645 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHGAP10645 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
CHGAP10645 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.36■■■■□ 3.25
CHGAP10645 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHGAP10645 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.35■■■■□ 3.25
CHGAP10645 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
CHGAP10645 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
CHGAP10645 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHGAP10645 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHGAP10645 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHGAP10645 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHGAP10645 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
CHGAP10645 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
CHGAP10645 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
CHGAP10645 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC35.29■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms