Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PTPRFP10586 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPRFP10586 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPRFP10586 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPRFP10586 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms