Protein–RNA interactions for Protein: P0DP72

VSIG10L2, V-set and immunoglobulin domain-containing protein 10-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSIG10L2P0DP72 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
VSIG10L2P0DP72 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
VSIG10L2P0DP72 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
VSIG10L2P0DP72 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.2 ms