Protein–RNA interactions for Protein: P0DP26

Calm1, Calmodulin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm1P0DP26 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Calm1P0DP26 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Calm1P0DP26 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Calm1P0DP26 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Calm1P0DP26 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.6 ms