Protein–RNA interactions for Protein: P0DMW5

SMIM10L2B, Small integral membrane protein 10-like protein 2B, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM10L2BP0DMW5 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMIM10L2BP0DMW5 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
SMIM10L2BP0DMW5 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SMIM10L2BP0DMW5 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SMIM10L2BP0DMW5 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms