Protein–RNA interactions for Protein: P0DJI8

SAA1, Serum amyloid A-1 protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SAA1P0DJI8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAA1P0DJI8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAA1P0DJI8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
SAA1P0DJI8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAA1P0DJI8 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAA1P0DJI8 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
SAA1P0DJI8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
SAA1P0DJI8 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SAA1P0DJI8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAA1P0DJI8 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAA1P0DJI8 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SAA1P0DJI8 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAA1P0DJI8 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAA1P0DJI8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SAA1P0DJI8 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.8 ms