Protein–RNA interactions for Protein: P0CI25

TRIM49, Tripartite motif-containing protein 49, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM49P0CI25 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TRIM49P0CI25 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
TRIM49P0CI25 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
TRIM49P0CI25 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
TRIM49P0CI25 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms