Protein–RNA interactions for Protein: P09041

Pgk2, Phosphoglycerate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgk2P09041 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Pgk2P09041 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Pgk2P09041 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Pgk2P09041 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Pgk2P09041 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Pgk2P09041 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.5 ms