Protein–RNA interactions for Protein: P09012

SNRPA, U1 small nuclear ribonucleoprotein A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPAP09012 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNRPAP09012 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
SNRPAP09012 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNRPAP09012 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms