Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT7P08729 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
KRT7P08729 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT7P08729 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
KRT7P08729 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
KRT7P08729 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT7P08729 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT7P08729 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT7P08729 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
KRT7P08729 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
KRT7P08729 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
KRT7P08729 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
KRT7P08729 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT7P08729 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT7P08729 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT7P08729 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT7P08729 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT7P08729 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
KRT7P08729 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT7P08729 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT7P08729 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT7P08729 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
KRT7P08729 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
KRT7P08729 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
KRT7P08729 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT7P08729 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT7P08729 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT7P08729 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT7P08729 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
KRT7P08729 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT7P08729 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT7P08729 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
KRT7P08729 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT7P08729 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT7P08729 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT7P08729 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
KRT7P08729 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
KRT7P08729 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
KRT7P08729 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT7P08729 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT7P08729 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
KRT7P08729 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
KRT7P08729 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT7P08729 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
KRT7P08729 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT7P08729 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT7P08729 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT7P08729 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT7P08729 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
KRT7P08729 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms