Protein–RNA interactions for Protein: P08607

C4bpa, C4b-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C4bpaP08607 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
C4bpaP08607 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C4bpaP08607 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
C4bpaP08607 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C4bpaP08607 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms