Protein–RNA interactions for Protein: P05090

APOD, Apolipoprotein D, humanhuman

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APODP05090 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
APODP05090 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
APODP05090 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
APODP05090 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
APODP05090 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APODP05090 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APODP05090 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APODP05090 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
APODP05090 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
APODP05090 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APODP05090 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APODP05090 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
APODP05090 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
APODP05090 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
APODP05090 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
APODP05090 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
APODP05090 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
APODP05090 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APODP05090 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APODP05090 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APODP05090 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
APODP05090 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APODP05090 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
APODP05090 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APODP05090 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
APODP05090 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APODP05090 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
APODP05090 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APODP05090 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
APODP05090 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APODP05090 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
APODP05090 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
APODP05090 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
APODP05090 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
APODP05090 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APODP05090 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APODP05090 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APODP05090 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
APODP05090 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
APODP05090 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
APODP05090 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
APODP05090 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
APODP05090 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
APODP05090 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APODP05090 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APODP05090 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APODP05090 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
APODP05090 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APODP05090 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
APODP05090 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
APODP05090 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 255.9 ms