Protein–RNA interactions for Protein: P04632

CAPNS1, Calpain small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1P04632 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
CAPNS1P04632 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
CAPNS1P04632 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
CAPNS1P04632 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms