Protein–RNA interactions for Protein: P04183

TK1, Thymidine kinase, cytosolic, humanhuman

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TK1P04183 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TK1P04183 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TK1P04183 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TK1P04183 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TK1P04183 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
TK1P04183 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
TK1P04183 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
TK1P04183 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TK1P04183 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
TK1P04183 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TK1P04183 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TK1P04183 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TK1P04183 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
TK1P04183 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TK1P04183 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
TK1P04183 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TK1P04183 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TK1P04183 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
TK1P04183 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
TK1P04183 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
TK1P04183 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
TK1P04183 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
TK1P04183 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
TK1P04183 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TK1P04183 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
TK1P04183 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
TK1P04183 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
TK1P04183 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
TK1P04183 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
TK1P04183 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
TK1P04183 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TK1P04183 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TK1P04183 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
TK1P04183 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
TK1P04183 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
TK1P04183 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
TK1P04183 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
TK1P04183 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms