Protein–RNA interactions for Protein: P02771

AFP, Alpha-fetoprotein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AFPP02771 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
AFPP02771 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
AFPP02771 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AFPP02771 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AFPP02771 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
AFPP02771 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFPP02771 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFPP02771 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFPP02771 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFPP02771 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AFPP02771 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
AFPP02771 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFPP02771 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AFPP02771 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFPP02771 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AFPP02771 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFPP02771 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFPP02771 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AFPP02771 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFPP02771 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFPP02771 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AFPP02771 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFPP02771 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFPP02771 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFPP02771 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AFPP02771 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFPP02771 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFPP02771 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFPP02771 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFPP02771 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AFPP02771 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFPP02771 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFPP02771 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AFPP02771 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
AFPP02771 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFPP02771 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
AFPP02771 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
AFPP02771 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFPP02771 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFPP02771 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
AFPP02771 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
AFPP02771 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFPP02771 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFPP02771 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFPP02771 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFPP02771 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFPP02771 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
AFPP02771 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
AFPP02771 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFPP02771 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFPP02771 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFPP02771 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFPP02771 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
AFPP02771 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
AFPP02771 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.4 ms