Protein–RNA interactions for Protein: P02545

LMNA, Prelamin-A/C, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNAP02545 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
LMNAP02545 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNAP02545 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNAP02545 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNAP02545 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNAP02545 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
LMNAP02545 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
LMNAP02545 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNAP02545 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNAP02545 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNAP02545 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
LMNAP02545 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNAP02545 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNAP02545 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNAP02545 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
LMNAP02545 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMNAP02545 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
LMNAP02545 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
LMNAP02545 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
LMNAP02545 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNAP02545 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNAP02545 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNAP02545 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNAP02545 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNAP02545 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
LMNAP02545 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNAP02545 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNAP02545 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNAP02545 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
LMNAP02545 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNAP02545 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNAP02545 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNAP02545 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNAP02545 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNAP02545 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
LMNAP02545 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
LMNAP02545 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNAP02545 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNAP02545 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
LMNAP02545 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNAP02545 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNAP02545 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNAP02545 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNAP02545 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
LMNAP02545 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNAP02545 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNAP02545 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
LMNAP02545 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNAP02545 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNAP02545 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNAP02545 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
LMNAP02545 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
LMNAP02545 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNAP02545 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNAP02545 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
LMNAP02545 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
LMNAP02545 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNAP02545 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNAP02545 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNAP02545 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNAP02545 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
LMNAP02545 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNAP02545 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNAP02545 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNAP02545 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNAP02545 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNAP02545 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
LMNAP02545 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
LMNAP02545 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
LMNAP02545 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms