Protein–RNA interactions for Protein: P01794

Ig heavy chain V region HPCG14, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01794 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01794 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01794 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01794 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01794 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
P01794 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01794 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01794 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01794 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
P01794 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01794 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01794 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01794 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01794 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01794 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
P01794 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01794 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01794 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
P01794 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01794 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01794 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01794 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01794 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01794 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01794 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01794 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01794 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01794 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01794 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01794 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01794 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01794 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01794 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01794 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01794 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01794 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01794 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01794 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01794 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01794 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01794 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01794 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
P01794 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01794 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01794 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01794 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01794 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01794 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01794 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01794 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01794 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01794 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01794 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01794 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01794 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01794 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01794 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01794 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01794 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
P01794 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.4 ms