Protein–RNA interactions for Protein: P01678

Ig kappa chain V-VI region SAPC 10, mousemouse

Predictions only

Length 107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01678 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
P01678 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01678 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01678 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01678 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
P01678 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
P01678 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
P01678 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
P01678 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
P01678 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01678 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01678 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
P01678 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01678 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
P01678 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01678 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
P01678 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01678 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01678 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01678 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01678 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
P01678 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
P01678 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01678 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
P01678 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01678 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
P01678 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01678 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01678 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01678 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
P01678 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
P01678 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
P01678 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01678 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01678 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01678 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01678 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
P01678 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
P01678 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
P01678 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.33■■□□□ 1
P01678 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
P01678 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01678 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01678 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01678 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01678 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
P01678 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
P01678 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01678 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01678 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
P01678 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01678 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
P01678 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
P01678 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01678 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01678 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
P01678 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01678 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01678 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
P01678 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01678 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
P01678 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
P01678 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms