Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
P01649 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01649 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01649 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
P01649 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01649 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01649 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01649 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01649 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01649 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
P01649 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01649 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
P01649 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01649 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01649 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
P01649 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01649 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01649 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01649 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
P01649 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01649 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01649 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
P01649 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
P01649 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
P01649 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01649 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01649 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01649 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01649 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01649 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
P01649 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01649 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01649 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01649 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01649 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01649 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
P01649 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
P01649 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
P01649 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01649 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01649 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01649 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
P01649 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01649 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
P01649 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01649 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01649 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01649 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
P01649 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01649 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01649 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01649 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01649 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
P01649 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
P01649 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
P01649 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.9 ms