Protein–RNA interactions for Protein: P01647

Ig kappa chain V-V region HP 124E1, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01647 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01647 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
P01647 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01647 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
P01647 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01647 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01647 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01647 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01647 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01647 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
P01647 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
P01647 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01647 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
P01647 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
P01647 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01647 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
P01647 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
P01647 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01647 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01647 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01647 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01647 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
P01647 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
P01647 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01647 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
P01647 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
P01647 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
P01647 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01647 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
P01647 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
P01647 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
P01647 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
P01647 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01647 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01647 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01647 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01647 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
P01647 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01647 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01647 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01647 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
P01647 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
P01647 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
P01647 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01647 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01647 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
P01647 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01647 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01647 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01647 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
P01647 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01647 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01647 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01647 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01647 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
P01647 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01647 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01647 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01647 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01647 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
P01647 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01647 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01647 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01647 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01647 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
P01647 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01647 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01647 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01647 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01647 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
P01647 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
P01647 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01647 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
P01647 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01647 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01647 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01647 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
P01647 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01647 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
P01647 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01647 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
P01647 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms