Protein–RNA interactions for Protein: P01639

Gm5571, Ig kappa chain V-V region MOPC 41, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5571P01639 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Gm5571P01639 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Gm5571P01639 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gm5571P01639 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Gm5571P01639 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms