Protein–RNA interactions for Protein: O95602

POLR1A, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1AO95602 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.01■■■■□ 3.36
POLR1AO95602 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.01■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC36■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC35.99■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC35.97■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.96■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.35
POLR1AO95602 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC35.95■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC35.94■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC35.93■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC35.91■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC35.9■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC35.9■■■■□ 3.34
POLR1AO95602 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC35.85■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.84■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC35.83■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.33
POLR1AO95602 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC35.82■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC35.81■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC35.81■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC35.81■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC35.8■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC35.79■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC35.79■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC35.79■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC35.78■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC35.77■■■■□ 3.32
POLR1AO95602 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC35.75■■■■□ 3.31
POLR1AO95602 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms