Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
UBXN7O94888 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
UBXN7O94888 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
UBXN7O94888 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
UBXN7O94888 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.5 ms