Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lrrc6O88978 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lrrc6O88978 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lrrc6O88978 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Lrrc6O88978 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms