Protein–RNA interactions for Protein: O88346

Tnnt1, Troponin T, slow skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnt1O88346 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Tnnt1O88346 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Tnnt1O88346 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Tnnt1O88346 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Tnnt1O88346 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms