Protein–RNA interactions for Protein: O88188

Ly86, Lymphocyte antigen 86, mousemouse

Predictions only

Length 162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly86O88188 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly86O88188 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Ly86O88188 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Ly86O88188 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly86O88188 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ly86O88188 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly86O88188 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly86O88188 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ly86O88188 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ly86O88188 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms