Protein–RNA interactions for Protein: O75530

EED, Polycomb protein EED, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EEDO75530 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEDO75530 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEDO75530 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEDO75530 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEDO75530 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
EEDO75530 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
EEDO75530 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEDO75530 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEDO75530 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEDO75530 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
EEDO75530 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
EEDO75530 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEDO75530 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEDO75530 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEDO75530 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEDO75530 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
EEDO75530 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEDO75530 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
EEDO75530 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
EEDO75530 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
EEDO75530 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEDO75530 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
EEDO75530 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
EEDO75530 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEDO75530 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEDO75530 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
EEDO75530 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEDO75530 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEDO75530 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEDO75530 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEDO75530 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
EEDO75530 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
EEDO75530 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEDO75530 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEDO75530 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEDO75530 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
EEDO75530 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
EEDO75530 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
EEDO75530 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
EEDO75530 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
EEDO75530 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEDO75530 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEDO75530 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEDO75530 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
EEDO75530 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEDO75530 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEDO75530 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
EEDO75530 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEDO75530 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEDO75530 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEDO75530 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEDO75530 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEDO75530 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
EEDO75530 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEDO75530 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
EEDO75530 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms