Protein–RNA interactions for Protein: O75044

SRGAP2, SLIT-ROBO Rho GTPase-activating protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,071 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRGAP2O75044 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
SRGAP2O75044 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
SRGAP2O75044 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
SRGAP2O75044 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SRGAP2O75044 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 118.6 ms