Protein–RNA interactions for Protein: O70551

Srpk1, SRSF protein kinase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk1O70551 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Srpk1O70551 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Srpk1O70551 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Srpk1O70551 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Srpk1O70551 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.6 ms