Protein–RNA interactions for Protein: O60749

SNX2, Sorting nexin-2, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX2O60749 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX2O60749 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX2O60749 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX2O60749 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SNX2O60749 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX2O60749 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX2O60749 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX2O60749 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX2O60749 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SNX2O60749 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX2O60749 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX2O60749 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX2O60749 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX2O60749 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX2O60749 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SNX2O60749 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX2O60749 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX2O60749 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX2O60749 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SNX2O60749 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX2O60749 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX2O60749 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX2O60749 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX2O60749 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SNX2O60749 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX2O60749 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX2O60749 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX2O60749 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX2O60749 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX2O60749 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SNX2O60749 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX2O60749 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SNX2O60749 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SNX2O60749 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX2O60749 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX2O60749 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX2O60749 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SNX2O60749 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SNX2O60749 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX2O60749 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX2O60749 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX2O60749 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX2O60749 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SNX2O60749 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX2O60749 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX2O60749 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SNX2O60749 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
SNX2O60749 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX2O60749 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
SNX2O60749 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
SNX2O60749 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX2O60749 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX2O60749 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX2O60749 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
SNX2O60749 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX2O60749 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX2O60749 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX2O60749 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX2O60749 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX2O60749 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX2O60749 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX2O60749 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX2O60749 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
SNX2O60749 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX2O60749 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
SNX2O60749 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms