Protein–RNA interactions for Protein: O60563

CCNT1, Cyclin-T1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNT1O60563 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CCNT1O60563 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CCNT1O60563 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
CCNT1O60563 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
CCNT1O60563 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
CCNT1O60563 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCNT1O60563 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.57■■■□□ 2
CCNT1O60563 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
CCNT1O60563 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms