Protein–RNA interactions for Protein: O60547

GMDS, GDP-mannose 4,6 dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDSO60547 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMDSO60547 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMDSO60547 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMDSO60547 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMDSO60547 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMDSO60547 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
GMDSO60547 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
GMDSO60547 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMDSO60547 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMDSO60547 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMDSO60547 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
GMDSO60547 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
GMDSO60547 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
GMDSO60547 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
GMDSO60547 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GMDSO60547 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GMDSO60547 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GMDSO60547 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMDSO60547 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GMDSO60547 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GMDSO60547 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GMDSO60547 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GMDSO60547 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMDSO60547 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMDSO60547 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GMDSO60547 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMDSO60547 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GMDSO60547 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMDSO60547 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GMDSO60547 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GMDSO60547 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GMDSO60547 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GMDSO60547 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
GMDSO60547 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GMDSO60547 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GMDSO60547 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GMDSO60547 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
GMDSO60547 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
GMDSO60547 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GMDSO60547 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GMDSO60547 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GMDSO60547 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMDSO60547 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMDSO60547 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMDSO60547 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GMDSO60547 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GMDSO60547 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms