Protein–RNA interactions for Protein: O60312

ATP10A, Probable phospholipid-transporting ATPase VA, humanhuman

Predictions only

Length 1,499 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP10AO60312 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC37.12■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC37.1■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.09■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.53
ATP10AO60312 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC37.06■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.05■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC37.04■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.04■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC37.03■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.02■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.52
ATP10AO60312 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.01■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.01■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC37.01■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC37.01■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC37■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC36.99■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC36.98■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.98■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.97■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC36.96■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.95■■■■□ 3.51
ATP10AO60312 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC36.94■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC36.93■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC36.92■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC36.91■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC36.9■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.9■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.9■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.89■■■■□ 3.5
ATP10AO60312 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC36.88■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.87■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.86■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC36.85■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC36.84■■■■□ 3.49
ATP10AO60312 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.84■■■■□ 3.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms