Protein–RNA interactions for Protein: O55236

Rngtt, mRNA-capping enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RngttO55236 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RngttO55236 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RngttO55236 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RngttO55236 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
RngttO55236 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
RngttO55236 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
RngttO55236 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
RngttO55236 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
RngttO55236 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RngttO55236 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
RngttO55236 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
RngttO55236 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
RngttO55236 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RngttO55236 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RngttO55236 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
RngttO55236 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
RngttO55236 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RngttO55236 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
RngttO55236 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
RngttO55236 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RngttO55236 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RngttO55236 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RngttO55236 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
RngttO55236 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
RngttO55236 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RngttO55236 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
RngttO55236 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
RngttO55236 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RngttO55236 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
RngttO55236 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RngttO55236 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
RngttO55236 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
RngttO55236 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RngttO55236 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RngttO55236 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
RngttO55236 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
RngttO55236 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
RngttO55236 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
RngttO55236 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RngttO55236 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RngttO55236 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
RngttO55236 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RngttO55236 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 198.4 ms