Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Syngr2O55101 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Syngr2O55101 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Syngr2O55101 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms