Protein–RNA interactions for Protein: O54804

Chka, Choline kinase alpha, mousemouse

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Length 453 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkaO54804 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkaO54804 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
ChkaO54804 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkaO54804 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkaO54804 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkaO54804 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
ChkaO54804 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkaO54804 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ChkaO54804 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ChkaO54804 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkaO54804 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
ChkaO54804 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkaO54804 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ChkaO54804 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
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