Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.63■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
HTRA2O43464 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
HTRA2O43464 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
HTRA2O43464 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms