Protein–RNA interactions for Protein: O43365

HOXA3, Homeobox protein Hox-A3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 443 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA3O43365 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
HOXA3O43365 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
HOXA3O43365 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
HOXA3O43365 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms