Protein–RNA interactions for Protein: O43246

SLC7A4, Cationic amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A4O43246 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SLC7A4O43246 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
SLC7A4O43246 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SLC7A4O43246 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SLC7A4O43246 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.5 ms