Protein–RNA interactions for Protein: O35926

Cdk5r2, Cyclin-dependent kinase 5 activator 2, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5r2O35926 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cdk5r2O35926 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cdk5r2O35926 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cdk5r2O35926 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.1 ms