Protein–RNA interactions for Protein: O35903

Ccl25, C-C motif chemokine 25, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl25O35903 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccl25O35903 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ccl25O35903 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Ccl25O35903 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms