Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc27a2O35488 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc27a2O35488 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc27a2O35488 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.6 ms