Protein–RNA interactions for Protein: O15245

SLC22A1, Solute carrier family 22 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A1O15245 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SLC22A1O15245 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SLC22A1O15245 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SLC22A1O15245 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SLC22A1O15245 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 148.2 ms