Protein–RNA interactions for Protein: O15178

T, Brachyury protein, humanhuman

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TO15178 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TO15178 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TO15178 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TO15178 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TO15178 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TO15178 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TO15178 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TO15178 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TO15178 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TO15178 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TO15178 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TO15178 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TO15178 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TO15178 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TO15178 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TO15178 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TO15178 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TO15178 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TO15178 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TO15178 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TO15178 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TO15178 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
TO15178 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TO15178 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
TO15178 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
TO15178 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TO15178 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TO15178 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TO15178 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TO15178 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TO15178 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TO15178 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TO15178 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TO15178 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TO15178 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TO15178 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TO15178 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TO15178 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TO15178 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TO15178 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TO15178 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TO15178 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TO15178 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TO15178 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TO15178 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TO15178 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TO15178 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TO15178 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TO15178 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TO15178 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TO15178 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TO15178 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TO15178 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TO15178 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TO15178 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TO15178 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TO15178 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TO15178 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TO15178 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TO15178 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TO15178 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TO15178 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TO15178 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TO15178 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TO15178 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TO15178 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TO15178 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TO15178 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TO15178 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TO15178 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TO15178 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms