Protein–RNA interactions for Protein: O15078

CEP290, Centrosomal protein of 290 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 2,479 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP290O15078 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP290O15078 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
CEP290O15078 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CEP290O15078 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP290O15078 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CEP290O15078 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.95
CEP290O15078 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP290O15078 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CEP290O15078 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CEP290O15078 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP290O15078 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP290O15078 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CEP290O15078 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP290O15078 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP290O15078 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
CEP290O15078 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP290O15078 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP290O15078 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CEP290O15078 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CEP290O15078 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP290O15078 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP290O15078 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP290O15078 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CEP290O15078 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP290O15078 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP290O15078 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP290O15078 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP290O15078 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
CEP290O15078 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP290O15078 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP290O15078 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP290O15078 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CEP290O15078 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CEP290O15078 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
CEP290O15078 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP290O15078 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CEP290O15078 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP290O15078 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP290O15078 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP290O15078 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP290O15078 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP290O15078 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CEP290O15078 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CEP290O15078 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP290O15078 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CEP290O15078 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP290O15078 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP290O15078 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP290O15078 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CEP290O15078 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP290O15078 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP290O15078 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP290O15078 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP290O15078 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP290O15078 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
CEP290O15078 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP290O15078 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP290O15078 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
CEP290O15078 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CEP290O15078 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP290O15078 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP290O15078 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP290O15078 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CEP290O15078 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP290O15078 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP290O15078 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP290O15078 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
CEP290O15078 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP290O15078 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
CEP290O15078 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP290O15078 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CEP290O15078 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
CEP290O15078 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
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