Protein–RNA interactions for Protein: O14904

WNT9A, Protein Wnt-9a, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WNT9AO14904 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
WNT9AO14904 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
WNT9AO14904 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
WNT9AO14904 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
WNT9AO14904 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms