Protein–RNA interactions for Protein: O14545

TRAFD1, TRAF-type zinc finger domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAFD1O14545 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TRAFD1O14545 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TRAFD1O14545 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRAFD1O14545 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRAFD1O14545 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRAFD1O14545 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
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