Protein–RNA interactions for Protein: O00461

GOLIM4, Golgi integral membrane protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 696 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLIM4O00461 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
GOLIM4O00461 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GOLIM4O00461 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
GOLIM4O00461 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GOLIM4O00461 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GOLIM4O00461 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms