Protein–RNA interactions for Protein: O00267

SUPT5H, Transcription elongation factor SPT5, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUPT5HO00267 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.84■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC43.83■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC43.82■■■■■ 4.61
SUPT5HO00267 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC43.81■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC43.81■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.81■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.8■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC43.78■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC43.78■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC43.77■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC43.77■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC43.77■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.76■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.76■■■■■ 4.6
SUPT5HO00267 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.75■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC43.73■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC43.73■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.72■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.72■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC43.71■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC43.71■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC43.71■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.59
SUPT5HO00267 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.69■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.69■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.68■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.68■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC43.67■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.66■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC43.66■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.65■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.65■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC43.65■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC43.64■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC43.63■■■■■ 4.58
SUPT5HO00267 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.62■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.61■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.6■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC43.58■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC43.57■■■■■ 4.57
SUPT5HO00267 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.55■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.54■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
SUPT5HO00267 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms